Kontraindikácia je okolnosť alebo stav pacienta, ktorý vylučuje niektoré liečebné postupy, diagnostické výkony alebo podanie niektorých liekov.
V prípade, že by boli kontraindikácie ignorované, môžu mať nežiaduci účinok a zhoršiť zdravotný stav pacienta po vyšetrení, lekárskom výkone alebo užití liekov. Mnoho liekov má kontraindikácie a nesmú sa užívať napríklad počas tehotenstva či kojenia. Zoznam kontraindikácií je vždy uvedený v príbalovom letáku.
Pri relatívnej kontraindikácii liečebný účinok prevyšuje negatívny vplyv. Väčšinou ide o liečebný efekt, ktorý je dôležitý pre správne fungovanie životných funkcií. Na kontraindikáciu sa v takom prípade neprihliada.
Absolútna kontraindikácia pomenúva jav, ktorý nesmie pacient za žiadnych okolností podstúpiť.